《女巫的孩子》讲述了一个发生在很久很久以前的故事，当时世界上仅存的最后一点魔法用一座幽深黑暗的森林将某个王国分成了两半。一边是女巫的孩子奈德和他的双胞胎兄弟塔姆，他们乘坐自制的木筏朝着大海划去，但不幸的是，湍急的河流吞噬了塔姆的生命。奈德虽然得救了，却成了“救错了的男孩”，在村民们的冷嘲热讽和父母浓得化不开的悲伤中艰难地成长。另一边是强盗的女儿安妮，她孤独而坚强地照看着生病的妈妈，但最终妈妈还是离开了。安妮的妈妈临终前为安妮留下了预言：“救错了的男孩会救你的命，你也能拯救他。还有狼——” 在神秘的森林里，一头失去母亲的小狼孤零零地游荡着，等待着……当奈德、安妮和小狼聚在一起，他们能互相信任，克服魔法的阻隔，化解横亘在森林两边的人们之间的矛盾吗？