故事发生在19世纪末，海面上出现了一只神秘的怪物，它频频袭击各国海轮，在全世界闹得沸沸扬扬。“我”作为一名生物学家，接到美国海军部的邀请，登上了一艘驱逐舰，参与“把海怪从海洋中清除出去”的行动。孰料行动刚一开始，“我”和伙伴就成为怪物的俘虏，随即被迫开始了一段历尽艰险、生死未卜的海底旅行……