生活在龙眼岛上的海博士长期从事海洋科学研究。由于全球温室气体不断增加，海啸、地震、酸雨等自然灾害频发，从浩瀚的海洋中寻找固碳和储碳的媒介，成为他思索的方向。恰在此时，一位渔民机缘巧合捡到一个神秘石蛋，海博士一眼判断这是具有高固碳能力的墨龙蛋。得知墨龙蛋是在马里亚纳海沟附近发现，于是，海博士带领两位少年助手，驾驶科考艇--“龙眼”号，前往世界深渊寻找神秘的固碳钥匙--墨龙，由此开启一趟神奇的海底冒险之旅……