《细菌世界历险记》一书所收录的作品由科学童话、科学小品、科学趣谈三个部分构成。科学童话的主人公菌儿是千千万万细菌中的一员，全书以菌儿自述的方式写成，菌儿时而在呼吸道里探险，时而在肠腔里开会，妙趣横生。科学小品和科学趣谈部分选取了数十篇精彩短文，虽然每篇不过数千字，却能带人领略科学世界的绮丽风光。