故事讲述了一个名叫汤姆的扫烟囱孩子，他经常受到虐待。一天，小汤姆在给一个爵爷家清扫烟囱时，惊醒了睡梦中的孩子，惊叫声吓得他从窗口逃走，人们误以为他是强盗而拼命追逐。汤姆逃到海边，水仙中的仙后把他变成了一个水孩子。他在水中结识了许多水中动物和许多与他一样的水孩子。汤姆在水中不断成长，决心将从前暴躁的自己改过。后来，在福善仙女的指点下，他帮助自己受难的师傅悔改了过去的恶行，同时自己也成长为一个正直善良的青年，最终成为了一个大科学家，他的本领都是在海底当水孩子的时候学来的。 .